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Des dizaines de milliers d'espèces de virus inconnus dans nos intestins

3/3/2021

Nos intestins abritent d'innombrables bactéries et virus. Un inventaire révèle de nombreux colocataires indéterminés.

Des billions de bactéries et de virus vivent dans nos intestins, la plupart d'entre eux sont inoffensifs, voire bénéfiques pour notre santé : cependant, la composition du microbiome et du virobiome n'est encore que partiellement comprise, comme le montre une étude d'Alexandre Almeida de l'Institut européen de bio-informatique de Hinxton et de son équipe dans « Cell » : les scientifiques ont identifié pas moins de 140 000 virus différents à partir de plus de 28 000 études sur la métagénomique. Plus de la moitié de ces virus étaient encore inconnus.

Pour la plupart, ils appartiennent au groupe des bactériophages, c'est-à-dire qu'ils infectent des bactéries pour contrôler ainsi leurs populations. Ils sont donc absolument nécessaires au maintien d'une flore intestinale saine. Un nombre réduit de bactériophages dans l'intestin est également considéré comme l'une des causes des maladies du système digestif. En outre, le matériel génétique de la plupart des virus se trouve sous forme d'ADN, alors que, par exemple, le Sars-CoV-2 et d'autres agents pathogènes appartiennent aux virus à ARN.

De nombreuses nouvelles espèces de virus font partie d'un groupe jusqu'ici également inconnu, dont les représentants remontent très probablement à un prédécesseur commun, appelé par les scientifiques « Gubaphage ». Selon les connaissances actuelles, ce dernier constitue le deuxième groupe le plus abondant de notre intestin après les crAssphages, découverts en 2014.

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