High-Performance Computational Solutions in Protein Bioinformatics.

Recenti sviluppi nella scienza informatica consentono l'uso efficiente di algoritmi precedentemente considerati troppo dispendiosi in termini di tempo per applicazioni in bioinformatica e scienze della vita. Questo lavoro si concentra sulle proteine e le loro strutture, sulla ricerca di somiglianze nelle strutture proteiche a livelli di rappresentazione principali e su varie tecniche che possono essere utilizzate per accelerare le ricerche di somiglianza. Diviso in quattro parti, la prima parte fornisce un modello formale delle strutture proteiche 3D per la genomica funzionale, la bioinformatica comparativa e la modellazione molecolare. La seconda parte si concentra sull'uso del multithreading per ricerche approssimative efficienti sulle strutture secondarie delle proteine. Le terza e quarta parte si concentrano sulla ricerca di somiglianze nelle strutture proteiche 3D con il supporto di GPU e cloud computing. Le parti tre e quattro descrivono entrambe l'accelerazione di diversi metodi. Il testo sarà di interesse per.