Genomsequenzierung mittels Ion Torrent PGM-Plattform

La decomposizione della biomassa morta è un compito essenziale in natura e rappresenta la base per nuove risorse nutritive. Oltre ai batteri, i funghi sono considerati importanti decompositori nell'ecosistema. La degradazione del legno nelle foreste temperate è principalmente effettuata dai basidiomiceti. Nell'ambito di questo lavoro, è stato sequenziato e annotato il genoma del basidiomicete degradatore di legno Mycena epipterygia. Per caratterizzare il meccanismo della degradazione enzimatica del materiale legnoso, il focus di questo studio è stato sull'identificazione di proteine secernenti selezionate. In particolare, sono stati considerati gli enzimi ligninolitici. Questi dati sono significativi per la ricerca medica e terapeutica, nella biotecnologia ambientale per la bonifica ecologica delle contaminazioni o nella produzione di biocarburanti. Il genoma di M. epipterygia è stato studiato per la prima volta in questo lavoro. Per l'analisi dei dati genomici è stato utilizzato software bioinformatico aggiornato. I risultati sono stati confrontati utilizzando database internazionali con funghi selezionati.